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臨床上常用監測腎功能的指標有有以下五種方法，各有其優缺點；(1)血清肌酸酐（Cr）、(2) Cockcroft-Gault 公式計算（C-G公式）的Ccr(3) 24小時尿液Ccr (4) 腎絲球過濾率(Estimated GFR)、以及(5)腎臟核醫掃描（如Tc -99m DTPA）等。

(1) 血清肌酸酐（Cr）
此方法的優點是簡便及便宜，但缺點是準確度較低。因為腎損傷初期，腎絲球過濾肌酸酐的能力受損，但是腎小管還有主動分泌排出肌酸酐的能力，所以腎病初期血清肌酸酐不會立即升高，一直要到腎功能下降到只剩大約正常人的二分之一或更低時，血清肌酸酐才會明顯上升。

(2） Cockcroft-Gault 公式計算（C-G公式）的肌酸酐清除率（Creatinine Clearance Rate，Ccr）：
利用已知的血清肌酸酐、年齡、體重、及性別代入以下公式可得預估的肌酸酐清除率。計算方式：【（140-年齡）x體重（公斤）】/【血清肌酸酐(mg/dL)x 72】, （女性要再乘以 0.85）。
但使用此公式之前提是受試者之血清肌酸酐於近期內(約兩週內)為一穩定狀態。可在門診或一般人在家中自行換算即可。

(3) 24小時尿液肌酸酐清除率（Ccr）：
此方法在醫院認同度高，但因需準確收集24小時尿液，故門診病人較不易正確執行；且收集保存上較不方便，故較適合住院病患來執行。
計算方式：24小時CCr (ml/min) =【尿中肌酸酐(mg/dL)x 24小時尿量 (ml)】/【血清肌酸酐(mg/dL)x1440分鐘】

(4) MDRD（Modification of Diet in Renal Disease）：MDRD-S-GFR
醫師常藉由腎絲球過濾率（GFR）指標來判定腎臟功能好壞，正常值為90～120 ml/min/1.73 m2。 所謂腎絲球過濾率（Glomerular Filtration Rate，GFR）是指腎臟在單位時間內清除血漿中某一物質的能力。於1999年國際研究發展出預估腎絲球過濾率（Estimated Glomerular Filtration Rate，eGFR）方式，到2005年重新修正。雖然美國國家腎臟病基金會（National Kidney Foundation, NKF）於腎臟慢性病防治工作準則中指出，eGFR為評估腎功能的最佳指標，但要注意的是此公式是由慢性腎臟病第三期以上的人所推得的公式，故使用此公式常造成第一和第二期的慢性腎臟病病人之eGFR低估；而第四和第五期的慢性腎臟病病人之eGFR易高估。

計算公式：MDRD-Simplify-GFR（mL/min/1.73 m2）= 186 x Scr -1.154 x Age -0.203 x 0.742 (if female)

(5)腎臟核醫掃描（如Tc -99m DTPA）
核醫掃描的優點是最準確，但缺點是費用較貴且有放射性之曝露，故不常使用。一般用於捐腎者之腎功能評估或需腎切除者之腎功能評估。